לשכת המדען הראשימשרד החקלאות ופיתוח הכפרקרן המדען הראשי נועדה ליזום ולהפעיל מחקרים המיועדים להחדיר חדשנות טכנולוגית ומדעית ולהשלים פערי ידע בתחומים בעלי חשיבות לאומית הדורשים שנוי או שיפור, ובתחומים בעלי פוטנציאל ליצירת מגזרי עיסוק חדשים וכלכליים בחקלאות ובהתיישבות הכפרית. יעדי המחקר והפיתוח של הקרן מתמקדים בין היתר בהגברת היצוא החקלאי, חיסכון בכח אדם, חיסכון וייעול השימוש במים, שיפור איכות תוצרת חקלאית, פיתוח חקלאות בת-קיימא וחיזוק ההתיישבות הכפרית בפריפריה, ומציאת פתרונות לאיומים הצפויים ממשבר המזון והמשבר הכלכלי-פיננסי שהתעצמו בשנה האחרונה וכן מהמשברים המתמשכים בתחומי האנרגיה ושנויי האקלים העולמיים; כל זאת לשם הגדלת יכולת הפרנסה של חקלאי ישראל ולמען צרכני השוק החקלאי.קביעת יעדי המו”פ המועדפים, ומיון ההצעות ההקדמיות, על פי יכולתן להתמודד עם דרישות המו”פ של יעדים אלה, מתבצעת באמצעות צוותי ההיגוי השונים.
